WordPressには、RSSなどのフィードのURLをhead要素に自動的に出力してくれる機能がありますが、 @glatyou さんのブログ（ http://webcre8.jp/ ）でhead要素内にフィードのlink要素が出ていないということだったので、その原因を探ってみたのでした。
フィードURL出力サンプル
<link rel="alternate" type="application/rss+xml" title="Simple Colors » フィード" href="https://www.warna.info/feed/" />
そもそも、head要素のテンプレート（大抵、header.php）には、フィードのURLに関する記述は一切ありません。
では、どのような仕組みで出力しているかというと、バージョンによって多少異なりますが、下記のようになっています。
WordPress 2.8, 2.9の場合
- 利用中のテーマの functions.php に、automatic_feed_links(); が記述されていれば、wp_head にて feed_links 関数が実行されるようフックの登録が行われる。
- wp_headフックにて feed_links 関数が実行され、フィードURLのlink要素を出力
WordPress 3.0, 3.1の場合
（正式リリースされていませんが、3.2もこの方式になりそうです）
- wp-includes/default-filters.php が読み込まれた段階で、wp_head にて feed_links 関数が実行されるようフックの登録が行われる。
- wp_headフックにて feed_links 関数が実行され、利用中のテーマが automatic-feed-links をサポートしていれば、フィードURLのlink要素を出力
具体的に何をチェックすべきかについては、下記３点になろうかと思います。（他にもファイルが壊れているなどの可能性もあるにはありますが。）
WordPress 2.8, 2.9の場合
- テンプレートファイルに wp_head(); が記述されているか
- テーマのfunctions.php に automatic_feed_links(); の記述があるか
- 利用しているプラグインが、feed_links のフックを削除したりしていないか
WordPress 3.0, 3.1の場合
- テンプレートファイルに wp_head(); が記述されているか
- テーマのfunctions.php に add_theme_support( ‘automatic-feed-links’ ); の記述があるか
- 利用しているプラグインが、feed_links のフックを削除したりしていないか
今回の場合は、自作のテーマにfunctions.php に、
add_theme_support( 'automatic-feed-links' );
の記述がなかったことが原因でした。
自分で１からテーマの作成を行う場合は、憶えておくと良いかと思います。